Однако в 90-е годы, в результате перехода от советской системы к рыночной, на первый план выступила минимизация роли государства в экономике, что негативно сказалось, в первую очередь, на развитии социальной и аграрной областях.

В результате данной политики аграрный сектор России в условиях переходного периода оказался в очень тяжелом положении. Для оживления аграрного сектора, обеспечения эффективного экономического развития именно государство должно брать на себя функцию распределения ресурсов и законодательного регулирования отраслью [1].

В условиях глобализации экономики потребность в государственном регулировании становится необходимым элементом для успешного развития всего государства в целом и его экономической составляющей, как одного из важнейших элементов национальной безопасности [2].

Необходимость жесткого государственного регулирования подтвердил и мировой экономический кризис 2007-2010 гг., который существенно ударил по всем отраслям экономики, особенно в странах с переходной экономикой. Во избежание повторения мирового продовольственного кризиса 2007-2010 гг. большинство стран мира поставило приоритетным направлением развитие инноваций в сельскохозяйственной сфере. Особую актуальность проблема государственного регулирования аграрного сектора приобрела в условиях санкционной политики направленной против России [3].

В условиях непрекращающихся санкций Россия активно должна внедрять инновации различного рода для успешного развития любого сектора экономики, реализовывать научно-технические достижения, создавая новые виды конкурентоспособной продукции.  При этом необходимо создавать производство, таким образом, чтобы максимально используя современные технологии, получать максимально возможную прибыль.  Политика санкций в экономике дает возможности для активизации деятельности отечественного производителя, но для этого необходимо создание таких условий, при которых отечественных производитель становится заинтересованной стороной в процессе. А это возможно при государственном регулировании экономикой страны, притоку инвестиций, созданию благоприятных условий для создания тяжелоемких отраслей (развитие животноводства) и конкурентоспособных предприятий, которые могли бы заменить зарубежных производителей и вытеснить их с отечественных рынков[4]. Именно применение инноваций в экономике создаст эффективное средство конкурентной борьбы, что в дальнейшем может способствовать формированию не только отечественного рынка, но и  к открытию и захвату новых рынков.

Важнейшим условием ускорения процесса интенсификации является государственное регулирование экономики, осуществляемое в двух основных формах: прямое государственное финансирование или создание льготных условий для тех предприятий, которые активно расширяют свою научно-исследовательскую деятельность, внедряют прогрессивную технику и технологию.

Важным аспектом государственного регулирования является формирование системы методов стимулирования научно-технического прогресса. Так как в переходный период, в условиях роста нестабильности и неопределенности, без сильных централизованных мер может произойти резкое снижение эффективности инноваций.

Для успешного развития экономики нашей страны необходимы стратегические изменения механизмов государственного регулирования: введение четкости в хозяйственное законодательство, демонополизация хозяйственной деятельности, эффективное стимулирование инвестиций при ужесточении наказаний в области коррупции, рост производительности труда, внедрение инноваций[5].

Политика санкций может стимулировать российскую экономику только при условии инновационного развития России.

Модернизацию аграрной отрасли на современном этапе развития России необходимо проводить по следующим ключевым направлениям: производственно-технологическим, селекционно-генетическим, социо-экологическим и организационно-управленческим инновациям. Последние два блока представляют особый интерес, поскольку именно от их успешного внедрения во многом зависит реформирование собственно государственной политики по управлению сельским хозяйством и сельскими территориями.