Применительно к использованию информационного сервиса выделяются следующие проблемы современных библиотек. В первую очередь, это низкий уровень или отсутствие автоматизации библиотечных процессов. Во-вторых, общий недостаток библиотечных кадров в библиотеках – уменьшает оперативность выполнения информационных запросов. Проблемой является и отсутствие системы непрерывного образования библиотекарей, в том числе и владению персональным компьютером. Сюда также можно отнести слабую материально-техническую базу библиотек, отсутствие координации управления библиотеками всех систем и ведомств. Отсутствует единая корпоративная библиотечная система, наблюдается низкая заработная плата библиотечных работников, что уменьшает мотивацию сотрудников к качественной работе.

Общий парк компьютерной техники библиотек малых городов в основном колеблется от одного до десятка единиц (от второго поколения компьютеров до Pentium). Более половины библиотек в небольших городах не имеют баз данных на CD-ROM, что объясняется финансовыми трудностями по закупке дорогостоящих баз данных и CD-ROM драйвов. Практически все библиотеки в настоящее время используют компьютерную технику для организационно-канцелярской деятельности, а в целях автоматизации внутренних библиотечных процессов, таких как обработка и каталогизация получаемой литературы и другое – значительно реже.

В большинстве библиотек пользователи не имеют непосредственного доступа к базам данных и электронным каталогам библиотеки, предоставление информации осуществляется через посредников – сотрудников обслуживающих подразделений, а это удваивает время обслуживания. Специальное обучение читателей работе с компьютером и самостоятельному поиску в электронных каталогах и Интернет отсутствует практически во всех библиотечных учреждениях.

В процессе автоматизации деятельности небольших библиотек, создания электронных версий библиотек, электронных каталогов, при разработке программного обеспечения, а также в ходе практического использования электронных библиотек возникает множество разнообразных проблем, многие из которых не имеют пока удовлетворительного решения [2, с. 10]. Наиболее существенными из них являются такие виды проблем: технические, организационные, экономические, юридические и социальные.

К техническим проблемам можно отнести проблему разработки технологии формирования информационного фонда, например, что, в каком виде и каким способом представлять. Нерешенность проблемы со скоростью передачи информации, контролем и учетом формирования и использования информационных фондов затрудняет продвижение информационного сервиса в библиотеках.

Организационной проблемой является необходимость создания профессиональных коллективов сотрудников для разработки и эксплуатации электронных библиотек, которые бы включали в себя специалистов самого разного профиля.

К экономическим проблемам относят высокую стоимость внедрения информационных технологий, разработки электронных библиотек, значительную стоимость оборудования.

Юридические проблемы включают в себя проблемы по определению статуса электронных библиотек – что представляет собой электронная библиотека, ее права и обязанности, определение статуса информации в электронных библиотеках [1, с. 17]. Проблемы коммерческого использования информации, находящейся в электронных базах данных и проблемы конституционного права граждан на получение качественной информации.

Социальные проблемы – это неготовность научного сообщества небольших городов участвовать в создании  электронных библиотек и применять их в своей работе. Наблюдается малый опыт сотрудников и посетителей библиотек в использовании электронных библиотек и других информационных систем в рамках библиотечного процесса.

Перечисленные проблемы не могут быть решены какой-то одной библиотечной организацией и требуют консолидации сил специалистов в области информационных технологий, управления. Решение поставленных проблем требует также значительных финансовых и интеллектуальных инвестиций. К созданию электронных библиотек и внедрению информационных технологий в библиотечных учреждениях должны привлекаться специализированные организации и творческие коллективы, способные профессионально и качественно выполнить соответствующие участки работы.

Основной перспективой развития публичных библиотек в небольших городах является системное внедрение современных информационных технологий с целью популяризации библиотечных услуг у потенциальных читателей. Только своевременная адаптация и внедрение вновь появляющихся информационно-коммуникационных технологий в свою деятельность позволит в перспективе публичным библиотекам сохранить за собой приоритет в реализации социально значимой информационной функции, за счет этого выжить в конкурентной среде и сохраниться как социальный институт [3, стр. 59].